蛋白序列比对软件

一:谁能告诉我这个比对蛋白序列的软件是什么? 觉得可能是the protein coverage summazer(pcs),这个我没有用过……二:蛋白序列比对结果有的氨基酸序列不同但是颜色相同是什么意思?还有的会有一个或者两个点有事什么意...
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