一：谁能告诉我这个比对蛋白序列的软件是什么？
觉得可能是the protein coverage summazer(pcs)，这个我没有用过……
二：蛋白序列比对结果有的氨基酸序列不同但是颜色相同是什么意思？还有的会有一个或者两个点有事什么意思
序列不同但颜色相同表示虽然有不同的氨基酸，但是它们属于同一类，结构和功能很相似，有可能不影响蛋白整体效果；上方星号表示很保守，所有序列在这个位置的氨基酸都一样；点号表示比较保守，虽然有不同的氨基酸但是是同类（序列不同颜色相同）；没有标记表示不是很保守，有不同种类的氨基酸在这个位置出现。——根据我的经验回答的。
三：如何进行两蛋白质序列比对？
clustal x 可以做全序列比对
如果要做进化树 再用MEGA4.0
参考资料：wenku.baidu.com/...a.html
四：blast+怎么用蛋白序列比对核苷酸序列
不太明白你想问什么。用vector NTI等软件可以对两个序列进行序列比对，给出的positive值就可以看出同源度了。 若同时拿家族中3个序列进行比对，就可以得到进化树，更直观一点。
五：有没有根据序列预测蛋白质结构的软件
当然有根据序列预测蛋白质结构的软件 比如nnPredict，预测全alpha蛋白、全beta蛋白和alpha/beta蛋白的二级结构 PredictProtein，提供了序列搜索和结构预测服务。先搜索相似序列，然后构建多序列比对的轮廓，再在数据库中搜索相似的轮廓，然后用一套PHD程序来预测相应的结构特征，包括二级结构。返回的结果包含大量预测过程中产生的信息，还包含每个残基位点的预测可信度。
六：有没有根据序列预测蛋白质结构的软件
当然有根据序列预测蛋白质结构的软件
比如nnPredict，预测全alpha蛋白、全beta蛋白和alpha/beta蛋白的二级结构
PredictProtein，提供了序列搜索和结构预测服务。先搜索相似序列，然后构建多序列比对的轮廓，再在数据库中搜索相似的轮廓，然后用一套PHD程序来预测相应的结构特征，包括二级结构。返回的结果包含大量预测过程中产生的信息，还包含每个残基位点的预测可信度。
七：健身会影响身高吗
其实，这种担心是没有科学根据的，也可以说是一种误解。
我们知道。一个人的高矮取决于先天和后天两大因素。先天因素主要同遗传和种族有关。据研究，人的体长（身高）的遗传力高达0.75-0.92，即是说，男子身高约有75%、女子身高约有92%受到遗传变异的影响。男子只有 25%。女子仅有8%取决于后天其他因素。可见遗传对身高起着极为重要的作用。虽然父母高其儿女就不会矮，但高父母生下矮子女和矮父母生下较高子女的现象也不罕见。这说明其他因素对身高增长同样有很大的影响。从地域方面看，一般说来，寒冷地区的人间于热带地区的人，北方人高于南方人。 俗话说："腿长个子高。"在后天的众多因素中（包括营养健身健美锻炼左活条件、习惯、气候、地理环境和疾病等）． 尤其是青春期阶段下肢大、小腿长管状骨和脊柱骨的发育情况是影响人高矮的主要因素。这些长管状骨可分为骨骺和骨干两部分。在性成熟前，骨骺与骨干之间存在着一层骺软骨，称骺板或生长板。随着年龄的增加．骺软骨不断骨化变硬，同时不断长出预的软骨这样就保证了骨骼不断变长，身高不断增长，个子便不断地长高。一般来说女孩子到17～20岁、男孩子到20～25岁，四肢长骨骺软骨全部骨化，骨干和骨骺之间融合形成一条骺线，骨的长度停止增长，人的个子也就不长了。 但是，今年来的科学研究证明适宜的健美运动除能给骺软骨的增殖提供充足的原礼对其施以有益的"机械按摩"外在一定的负荷范围，动态压力更有于骺板的增长。在健美训练中采用负重推举或深蹲动作施加干下肢长骨的压力显然也将成为诱发骨骺长得长的有利因素。尤其是设计和选择一套科学的健美训练方也更有利于骨骼、肌肉和韧带的纵向生长发鼠有利于骺软骨的生长促使身体长高。因此，在骺软骨还没有停止生长以前，青少年应积极参加科学系统的健美训练则是该多影响身高后天因迂中最积极而最为有效的手段。 至于骺板会不会因健美训练过早停止上生长的问题，近年来国内外有些学者通过科学实验提出些新见解，但健美训练会促使提前完成骨化的资料却未见到。恰恰相反，我国的体育科研人员曾对15-16岁的男生的骨骺进行过动态观察，通过练习一年举重项目的对比情况来看，仅身高就比只从事一般体育活动的同龄少年高出约10厘米。确认全部被检查的学生骨骺发育正常，未见到骺板提前愈合的现象。因此得出练习举重不会引起抑制骨骺生长的结论。这一结论同样适用于青少年的健美训练。 我们认为16岁以前的青少年参加健美训练一定要因人而异，训练初期，不论年龄大小都要强调全面发展利循序渐进。要合理安排运动量。避免采用"成入模式他的训练方法"。健美训练的关键问题是器械练习的重量。早期训练阶段应以他自己每组练习能重复完成15～20次的重量为标准，每次训练课练习5-8个动作，每周训练2-3次为佳。切忌采用集中训练某一局动作与方法。应尽量避免练习那些过于紧张、持续时间长、憋气的耐力性
和静力性的练习动作。当有了一定的力量基础后，使可采用"重复循环健美训练?quot;，因为"重复循环健美训练法"不仅容易增长力量，能有效地提高心血管系统的功能和肌肉耐力而且能将许多软组织（骺软骨、肌腱、韧带、结缔组织等）受到的压力减到最小的程度。训练时教练员要认真监督辅导。监督辅导不仅是为了安全，更重要的是要让他们切实掌握正确的健美技术动作。 17岁以后，人体逐渐发育成熟，这个阶段不但可以系统地进行健美训练而已还可适当增大健美训练的负衙。因为肌肉增长最快的年龄阶......余下全文>>
八：求助各位大神！下面这张图是哪个软件的序列比对结果？生物信息学方面的 5分
我做DNA的motif分析时，有类似的结果，只不过是DNA的也就是ATCG。
我记得那个软件叫MEME，好像也可以做蛋白质序列的分析，你了解下MEME吧。
九：我想做一个对decorsin家族蛋白的序列比对从而找出它们的CYS序列保守性，请问该用什么样的序列比对软件？ 10分
直接去NCBI网上就能对比
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