一：分子实验中怎样设计引物
在ncbi上查基因序列,然后输入primer中,根据相关规则设计引物,然后把序列送生物公司,由他们根据你设计的序列合成引物,顺序就是这样的,你可以上网百度一个prim浮r的教程以及引物设计标准,分子实验里这是最基本的软件,有必要学着用
二：如何用dnaman软件设计引物及找到引物上的酶切位点
1）PCR 引物设计
首先，将目标 DNA 片段装入 Channel,并激活 Channel。点击主菜单栏中的 Primer 主菜
单，出现下
拉菜单，如下所示：
点击 Design PCR Primers for DNA 命令，出现下列对话框： 参数说明如下：
Primer locations on target 引物定位
其中包括下列选项：
Product size（扩增目的片段大小）
Sense primer (正向引物选择区)
Antisense primer(反向引物选择区)
Primer 引物特性包括 Length(引物长度)，Tm 值, GC 含量等参数；
Reject primer 引物过滤（将符合引物过滤条件的引物过滤掉）
包括下列选项：
3’dimer(可形成 3’端自我互补的碱基数)
Hairpin stem(可形成发卡颈环结构的碱基数)PolyN(多聚碱基)
3’Uique(3’端严格配对碱基数)
Primer-Primer(含义未知)
All matches(引物互补配对百分数)
Consentrations 浓度设定
Product for hybridyzat（ion） PCR 产物用于 Southern Blot 探针杂交
点击按钮，出现下列对话框：
.选择需要的选项，点击按钮，出现：
点击按钮，完成操作。
2）DNA 序列的限制性酶切位点分析
将待分析的序列装入 Channel，点击要分析的 Channel，然后通过 Restriction/Analysis
命令打开对
话框，如下所示：
参数说明如下：
Results 分析结果显示
其中包括：
Show summary（显示概要） Show sites on sequence（在结果中显示酶切位点）
Draw restriction map（显示限制性酶切图）Draw restriction pattern（显示限制性酶
切模式图）
Ignore enzymes with more than（忽略大于某设定值的酶切位点）
Ignore enzymes with less than（忽略小于某设定值的酶切位点）
Target DNA （目标 DNA 特性）
circular（环型 DNA），dam/dcm methylation（dam/dcm 甲基化）
all DNA in Sequence Channel（选择此项，在 Sequence Channel 中的所有序列将被
分析，如果
选择了 Draw restriction pattern，那么当所有的 channel 中共有两条 DNA 时，则只能选择两个酶
分析，如果共有三个以上 DNA 时，则只能用一个酶分析。
选择所需的项目，然后按提示操作点击按扭，出现下列对话框：
参数说明如下：
Enzyme
代表（enzyme data file），点击旁边的下拉按钮，出现两个默认选项，restrict.enz 和
dnamane.enz，
如果添加过自制的酶列表，则附加显示自制酶列表文件名。其中 restrict.enz 数据文件包
含 180 种
限制酶，dnamane.enz 数据文件包含 2524 种限制酶。选择其中一个数据文件，相应的
酶在左边的
显示框中列出（按酶名称字母表顺序），鼠标双......余下全文>>
三：primer premier 6怎样设计引物
引物设计有3 条基本原则：首先引物与模板的序列要紧密互补，其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构，再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA 聚合反应(即错配)。引物设计应注意如下要点： 1 引物的长度一般为15-30 bp，常用的是18-2
四：怎么使用Vector NTI 11.5设计引物.急，求详细步骤
VECTOR设计引物必须为特异性性引物首先需要注意酶切位点位置.其次为了保证得到完整的酶切位点及准确性一般距离位点50-100BP碱基处设计引物.设计引物具体原则如下：
测序用引物要求非常严格,不同于PCR用引物.PCR用引物一般只要能和模板结合,3’端的几个碱基能完全配对,即使引物长达80～100多个碱基,只要调整PCR反应条件,也能成功进行PCR反应.而测序用引物便不一样了,必须严格符合以下要求.
(1)长度在18～25个碱基左右,一般选择20个碱基(根据GC含量作适当调整),
(2)3’端尽量选择G或C碱基(但不绝对),以增加与模板的结合能力.
(3)Tm温度应选择50℃～70℃左右.
(4)GC含量应选择在50%左右,尽量避开A、T、G、C的连续结构.
(5)避开引物自身形成发夹结构或引物二聚体结构等复杂结构.
(6)保证引物和模板100%匹配,特别是3’端的几个碱基一定要100%匹配.同时必须严格保证引物和模板之间只能有一个结合位点.
五：谁会用primer premier6.0设计引物啊。具体步骤{最好有截图}一步一步。有帮助的话，我再奖励50分。拜托。
手头的电脑没装。。。如果没记错的话 new sequence---DNA sequence---as it is---research primer---设置引物位置范围和产物长度----出来打分的引物---edit里面点copy 然后出来粘贴上
六：请问用primer premier6.0怎么设计简并引物。使用手册里面讲的align功能区在哪儿，怎么操作，需要具体指导 5分
这么困难的问题怎么才给5 多给点
七：求oligo 7软件使用说明或者教程。
Oligo使用方法介绍
作为目前最好、最专业的引物设计软件，Oligo的功能很强，在这里我们介绍它的一些主要功能：如：普通引物对的搜索、测序引物的设计、杂交探针的设计以及评估引物对质量等等。
在正式进行引物设计前，我们首先面临的一个任务就是向Oligo程序导入模板序列，根据不同的实验情况，导入模板有三种方法：
1， 直接用键盘输入：
a， 点击file菜单中的New Sequence 浮动命令，或直接点击工具栏中的New Sequence命令，进入序列展示窗口；
b， 此时即可键入DNA序列；
c， 如果需要的话，Oligo提供碱基回放功能，在边键入时边读出碱基，防止输入错误。点击Edit菜单中的“Readback on”即可。
2， 利用复制和粘贴：当我们序列已经作为TXT文件存在或其它oligo不能直接open的文件格式，如word文件.html格式，这个功能就显得很有用了。在相应文件中复制序列后在序列展示窗口粘贴，oligo会自动去除非碱基字符。当序列输入或粘贴完成后，点击Accept/Discard菜单中的Accept浮动命令，即可进入引物设计模式。
3， 如果序列已经保存为Seq格式或者FASTA，GenBank格式时，oligo就可以直接打开序列文件。
点击File菜单中的“Open”浮动命令，找到所需文件，打开即可。
进入引物设计模式后，oligo一般会弹出三个窗口，分别是6－碱基频率窗口，碱基退火温度窗口以及序列内部碱基稳定性窗口，其中的退火温度窗口是我们引物设计的主窗口，其它的两个窗口则在设计过程中起辅助作用，比如6－碱基频率窗口可以使我们很直观地看到所设计引物在相应物种基因组中的出现频率，如果我们的模板是基因组DNA或混合DNA时，该信息就显得有用了，而内部稳定性窗口则可以显示引物的5’端稳定性是否稍高于3’端等。
一，普通引物对的搜索：
以Mouse 4E（cDNA序列）为例。我们的目的是以Mouse 4E（2361 bp）为模板，设计一对引物来扩增出600－800bp长的PCR产物。
1，点击“Search“菜单中的”For Primers and Probes“命令，进入引物搜索对话框；
2，由于我们要设计的是一对PCR引物，因此正、负链的复选框都要选上，同时选上Compatible pairs。
在Oligo默认的状态下，对此引物对的要求有：a，无二聚体；b，3’端高度特异，GC含量有限定，d，去除错误引发引物等。
3，剩下的工作是确定上、下游引物的位置及PCR产盯的长度以及引物设计参数。
①单击：“search Ranges”按钮，弹出“Search Ranges”对话框。输入上游引物的范围：1－2000，下游引物的位置：100－2300；PCR产物的长度600－800bp。
②单击“Paramaters”按钮进入“Search Parameters”对话框，对话框种分三个活页，分别是：不同设定，参数以及更多参数。
③在“普通设定”窗口，为我们提供了对引物非常直观的设定方法，从高到低分六个等级，最后还有一个用户定制选项。
④当我们对引物的各种参数的含义及应该设定多大值并不是特别清楚时，就可以直接设定Very high/High等来完成对引物设计参数的设定。
⑤当我们选中“Automatically Change String”后，Oligo会在引物搜索过程中：如果在高等级设定中无法找到引物对时自动降低一个定级来进行搜索，知道找到引物对。在设计反向PCR引物对时，就选中“In......余下全文>>
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