一：原核转录组为什么建链特异性文库
链特异性转录组测序（strand-specific RNA sequencing）是指在构建测序文库时，利用Illumina高保真Taq酶将mRNA链的方向信息保存到测序文库中。测序后的数据分析可确定转录本是来自正义还是反义DNA链。与普通转录组测序相比，它更能准确地统计转录本的数量和确定基因的结构，同时可以发现更多的反义转录本，目前被广泛地应用于研究基因结构和基因表达调控等领域范围。
二：如何使用igv查看测序是否是链特异
打开我的电脑：你会看到C盘，D盘....最后一下是光驱，如果光驱是写上DVD-RW就是DVD刻录机，可以刻DVD，CD，VCD；如果写的是CD-RW，只能刻VCD及CD；如果没有RW，就是CD或DVD刻不了光盘的；另，如果查到是刻录机，却刻不了相对的DVD或CD，那么不是光盘有问题就是刻录机有问题了。
三：为什么long noncoding rna 宜采用链特异性方式建库
定义 长链非编码RNA(long noncoding RNA, lncRNA) ◆ 长度在200-100000 nt之间的RNA分子 ◆不编码蛋白 ◆ lncRNA参与细胞内多种过程调控 ◆种类、数量、功能都不明确 ◆Antisense lncRNA (反义长非编码RNA) ◆Intronic transcript (内含子非编码RNA) ◆...
四：2． 网站的地图上都有火龙洞，可是怎么进？好多人都不知道，知道的朋友能不能说一下怎么走法
呃~没去过
五：DNA的正负链是如何规定的
根据中心法则,DNA转录成mRNA,mRNA翻译成蛋白质.
其中mRNA只能从一条DNA链,根据碱基互补配对转录形成一条RNA链,这条链叫anti-sense strand无义链或者叫template strand模板链.因为它与mRNA序列互补.
mRNA与另一条链序列相同,除了T被U取代
六：DNA测序的测序原理
DNA测序的测序原理：
DNA测序是指分析特定DNA片段的碱基序列，也就是腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T）、胞嘧啶（C）与鸟嘌呤的（G）排列方式。快速的DNA测序方法的出现极大地推动了生物学和医学的研究和发现。
其原理是化学试剂处理末段DNA片段，造成碱基的特异性切割，产生一组具有各种不同长度的DNA链的反应混合物，经凝胶电泳分离。化学切割反应：包括碱基的修饰修饰的碱基从其糖环上转移出去在失去碱基的糖环处DNA断裂。
另一个原理是利用一种DNA聚合酶来延伸结合在待定序列模板上的引物。直到掺入一种链终止核苷酸为止。每一次序列测定由一套四个单独的反应构成，每个反应含有所有四种脱氧核苷酸三磷酸(dNTP)，并混入限量的一种不同的双脱氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基团，使延长的寡聚核苷酸选择性地在G、A、T或C处终止。终止点由反应中相应的双脱氧而定。每一种dNTPs和ddNTPs的相对浓度可以调整，使反应得到一组长几百至几千碱基的链终止产物。它们具有共同的起始点，但终止在不同的的核苷酸上，可通过高分辨率变性凝胶电泳分离大小不同的片段，凝胶处理后可用X-光胶片放射自显影或非同位素标记进行检测。
七：Strand-Specific RNA–Seq Analysis
RNA–Seq 转录组测序分析法
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